Retour d’expéRiences sur la Recherche Reproductible (R4)
Les outils informatiques ont profondément changé tous les aspects de la recherche scientifique, nous permettant de traiter des modèles bien plus complexes et des jeux de données bien plus grands qu’auparavant. En contrepartie, l’évolution rapide et la faible fiabilité qui caractérisent les logiciels ont contaminé les résultats de recherche obtenus avec leur aide. Il est aujourd’hui difficile de reproduire à l’identique un résultat de calcul au bout de quelques mois, et quasiment impossible de vérifier un résultat publié dans un article scientifique.
La Recherche Reproductible vise à corriger ce défaut par la transparence et la traçabilité: on ne publie pas seulement un résultat, mais aussi les données initiales et le code qui fait le calcul. Le principe est simple, mais son application n’est pas facile. Au cours de l’atelier, des pionniers de cette approche montrent comment ils ont réussi à la mettre en oeuvre.
Comité scientifique
- Konrad HINSEN
CBM, Orléans - Andrew DAVISON
UNIC, Gif sur Yvette - Christophe POUZAT
MAP5, Paris
Comité d’organisation
- Gerald KNELLER
MISC (Maison Interdisciplaire des Systèmes Complexes) - Jean-Louis ROUET
CaSciModOT (Calcul Scientifique et Modélisation Orléans Tours)
Programme de l’atelier
Jeudi 3 décembre
14h00 – 14h30 Ouverture
14h30 – 15h30 Arnaud LEGRAND
La recherche reproductible et l’Open Science: enjeux, objectifs, approches, outils à disposition
15h30 – 16h00 Pause
Thème: Préservation de logiciels et de données
16h00 – 16h45 Roberto DI COSMO
La préservation des logiciels: défis et opportunités pour la reproductibilité en science et technologie
16h45 – 17h15 Guillaume CHEVROT
Applications de la technologie ActivePapers pour la biologie computationnelle
17h15 – 17h45 Pause
Thème: Calculs numériques
17h45 – 18h30 Pacôme EBERHART
Estimation de la reproductibilité numérique grâce à l’arithmétique stochastique
18h30 – 19h00 Philippe Langlois
Cas d’études de calculs parallèles numériquement reproductibles
19h00 Cocktail
Vendredi 4 décembre
Thème: Publications reproductibles
09h30 – 10h00 Eva THEUMANN-WESFREID
IPOL (Image Processing On Line): présentation et retours
10h00 – 10h30 Nicolas ROUGIER
ReScience, refaire la science
10h30 – 11h00 Pause
Thème: Calculs parallèles et distribuées
11h00 – 11h30 David HILL
Simulation parallèles stochastiques reproductibles
11h30 – 12h00 Lucas NUSSBAUM
Grid’5000: une plate-forme expérimentale pour la recherche reproductible en informatique distribuée
12h00 – 12h30 Rémy LÉONE
La recherche reproductible dans les réseaux de capteurs
12h30 – 14h00 Déjeuner
Thème: Rendre le calcul compréhensible
14h00 – 15h00 Arnaud LEGRAND
La programmation littérale en action
15h00 – 15h45 Sébastien LI-THIAO-TE
Comment reprendre le code d’un de vos collègues
16h00 FIN
Informations pratiques
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