December 3, 2015 - December 4, 2015

Retour d’expéRiences sur la Recherche Reproductible (R4)

Atelier MISC / CaSciModOT  Retour d’expéRiences sur la Recherche Reproductible  (R4)

Les outils informatiques ont profondément changé tous les aspects de la recherche scientifique, nous permettant de traiter des modèles bien plus complexes et des jeux de données bien plus grands qu’auparavant. En contrepartie, l’évolution rapide et la faible fiabilité qui caractérisent les logiciels ont contaminé les résultats de recherche obtenus avec leur aide. Il est aujourd’hui difficile de reproduire à l’identique un résultat de calcul au bout de quelques mois, et quasiment impossible de vérifier un résultat publié dans un article scientifique.

La Recherche Reproductible vise à corriger ce défaut par la transparence et la traçabilité: on ne publie pas seulement un résultat, mais aussi les données initiales et le code qui fait le calcul. Le principe est simple, mais son application n’est pas facile. Au cours de l’atelier, des pionniers de cette approche montrent comment ils ont réussi à la mettre en oeuvre.

Comité scientifique

  • Konrad HINSEN 
    CBM, Orléans
  • Andrew DAVISON
    UNIC, Gif sur Yvette
  • Christophe POUZAT 
    MAP5, Paris

Comité d’organisation

  • Gerald KNELLER
    MISC (Maison Interdisciplaire des Systèmes Complexes)
  • Jean-Louis ROUET
    CaSciModOT (Calcul Scientifique et Modélisation Orléans Tours)

Programme de l’atelier

Jeudi 3 décembre

14h00 – 14h30 Ouverture

14h30 – 15h30 Arnaud LEGRAND

La recherche reproductible et l’Open Science: enjeux, objectifs, approches, outils à disposition

15h30 – 16h00 Pause

Thème: Préservation de logiciels et de données

16h00 – 16h45 Roberto DI COSMO

La préservation des logiciels: défis et opportunités pour la reproductibilité en science et technologie

16h45 – 17h15 Guillaume CHEVROT

Applications de la technologie ActivePapers pour la biologie computationnelle

17h15 – 17h45 Pause

Thème: Calculs numériques

17h45 – 18h30 Pacôme EBERHART

Estimation de la reproductibilité numérique grâce à l’arithmétique stochastique

18h30 – 19h00 Philippe Langlois

Cas d’études de calculs parallèles numériquement reproductibles

19h00 Cocktail

Vendredi 4 décembre

Thème: Publications reproductibles

09h30 – 10h00 Eva THEUMANN-WESFREID

IPOL (Image Processing On Line): présentation et retours

10h00 – 10h30 Nicolas ROUGIER

ReScience, refaire la science

10h30 – 11h00 Pause

Thème: Calculs parallèles et distribuées

11h00 – 11h30 David HILL

Simulation parallèles stochastiques reproductibles

11h30 – 12h00 Lucas NUSSBAUM

Grid’5000: une plate-forme expérimentale pour la recherche reproductible en informatique distribuée

12h00 – 12h30 Rémy LÉONE

La recherche reproductible dans les réseaux de capteurs

12h30 – 14h00 Déjeuner

Thème: Rendre le calcul compréhensible

14h00 – 15h00 Arnaud LEGRAND

La programmation littérale en action

15h00 – 15h45 Sébastien LI-THIAO-TE

Comment reprendre le code d’un de vos collègues

16h00 FIN

Informations pratiques

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